<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Journal of Advanced Biomedical Sciences</title>
<title_fa>مجله علوم زیست پزشکی پیشرفته</title_fa>
<short_title>J Adv Biomed Sci.</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://jabs.fums.ac.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>2228-5105</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2783-1523</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>8</journal_id_pii>
<journal_id_doi>7</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>14</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>8888</journal_id_nlai>
<journal_id_science>13</journal_id_science>
<language>en</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1398</year>
	<month>6</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2019</year>
	<month>9</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>9</volume>
<number>3</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>تشخیص کلستریدیوم دیفیسیل و بررسی توکسین‌های A و B از مبتلایان به اسهال مزمن با روش‌های کشت و PCR</title_fa>
	<title>Detection of Clostridium difﬁcile associated diarrhea in disease based on Polymerase chain reaction and bacterial culture And toxin A, B frequency</title>
	<subject_fa>ميكروبیولوژی</subject_fa>
	<subject>Microbiology</subject>
	<content_type_fa>پژوهشي</content_type_fa>
	<content_type>Research</content_type>
	<abstract_fa>&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;زمینه و هدف: &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;کلستریدیوم دیفیسیل باسیل گرم مثبت، بی&#8204;هوازی اجباری است. تشخیص دقیق و سریع یکی از مسائل مهم در کنترل عفونت کلستریدیوم دیفیسیل است. مطالعه حاضر باهدف مقایسه دو روش کشت و واکنش زنجیره&#8204;ای پلیمراز در تشخیص کلستریدیوم دیفیسیل از بیماران مبتلابه اسهال و بررسی توکسین&#8204;های &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;A&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; و &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;B&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; در این نمونه&#8204;ها است.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;مواد و روش&#8204;ها: &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;68 نمونه از بیماران بستری در بیمارستان&#8204;های قم جمع&#8204;آوری گردید. همه نمونه&amp;shy;ها به&#8204;سرعت روی محیط &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;CCFA&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; کشت و در شرایط بی&#8204;هوازی گرما گذاری شدند. پس&#8204;ازاین اقدامات، باکتری&#8204;های موردنظر جهت استخراج &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;DNA&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; و سپس انجام &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; بر روی ژن &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;cdd3&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;جهت تشخیص قطعی باکتری به کار گرفته شد؛ محصول &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; آن &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;622bp&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; است و برای توکسین&#8204;های &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;A&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; و &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;B&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; بایستی قطعاتی با طول 473 و 272 جفت باز گرفته شود.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;نتایج: &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;مورفولوژی پرگنه&#8204;&amp;shy;های کلستریدیوم دیفیسیل بر روی محیط&amp;shy;های مختلف بسیار متفاوت است. از مجموع 68 نمونه مدفوع استفاده&#8204;شده، 11 کشت مثبت به دست آمد. 16 ایزوله کلستریدیوم دیفیسیل ازنظر ژن &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;cdd3&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; مثبت بودند که در 6 مورد دارای هر دو توکسین و 4 مورد دارای توکسین &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;A&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; و 3 مورد توکسین &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;B&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; را برای اساس ژن&#8204;های مورد انتظار دارا بودند.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;نتیجه&#8204;گیری: &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;روش سیتوتوکسیتی به&#8204;عنوان روش &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;gold standard&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; برای این باکتری است. به&#8204;منظور پیشگیری از شیوع بالای این باکتری، استفاده از روش&#8204;های شناسایی بسیار مهم است که تکنیک &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;در مقایسه با روش&#8204;های کشت روشی مناسب برای تشخیص سریع باکتری کلستریدیوم دیفیسیل است این روش در زمان کمتری انجام&#8204;شده و همچنین از اختصاصیت بالایی برخورداراست.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;br&gt;
&amp;nbsp;</abstract_fa>
	<abstract>&lt;strong&gt;Detection of Clostridium Difﬁcile Associated Diarrhea in Disease Based on Polymerase Chain Reaction and Bacterial Culture and Toxin A, B Frequency&lt;/strong&gt;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;Detection of Clostridium Difﬁcile Associated Diarrhea in Disease&lt;/strong&gt;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;em&gt;Background &amp; Objective:&lt;/em&gt;&lt;/strong&gt; Clostridium difﬁcile is an obligate anaerobic, gram positive bacillus. The purpose of this study was to comparison between PCR technique and bacterial culture for assessing the prevalence of Clostridium difﬁcile infection in the samples of watery diarrhea.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;em&gt;Materials &amp; methods:&lt;/em&gt;&lt;/strong&gt; This cross-sectional qualitative study was performed in 68 samples of watery diarrhea in Qom province hospitals. All samples were cultured in the specialized CCFA Agar medium. Specific primers were applied for the PCR Assay based on &lt;em&gt;cdd3 &lt;/em&gt;gene. Based on this primer PCR product for this gene must be 622bp.toxin A &amp; B diagnosis based on specific primers and product must be 473 and 272 bp&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;em&gt;Results:&lt;/em&gt;&lt;/strong&gt; In this study, the optimized PCR technique was determined to be bacterium in 16 samples. But bacteria diagnosis in 11 samples by culture method. 6 samples have toxin A and B, 4samples has toxin A and 3 samples has toxin B.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;em&gt;Conclusion:&lt;/em&gt;&lt;/strong&gt; Cytotoxicity method is gold standard for clostridium difﬁcile. Diagnosis of these bacteria is very important and PCR was found as an applicable, sensitive, and quick technique for detection of Clostridium difﬁcile in compromise culture medium method.&lt;br&gt;
&amp;nbsp;</abstract>
	<keyword_fa>اسهال, PCR, ژن cdd3, کلستریدیوم دیفیسیل, توکسین A و B</keyword_fa>
	<keyword>diarrhea, PCR, ccd3 gene, Clostridium difﬁcile, toxin A, B</keyword>
	<start_page>1596</start_page>
	<end_page>1604</end_page>
	<web_url>http://jabs.fums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-2134-1&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>mohsen</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>zargar</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>محسن</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>زرگر</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>zmohsen2000@yahoo.com</email>
	<code>0381229165</code>
	<orcid>100319475328460019734</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Department of Microbiology, Qom Branch, Islamic Azad University, Qom, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکروبیولوژی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد قم، قم، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>ali</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>javadi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>علی</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>جوادی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>Abbasmorovvati@gmail.com</email>
	<code>0381418138</code>
	<orcid>100319475328460019735</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Bacteriology, Faculty of Health, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه باکتری‌شناسی پزشکی، دانشکده بهداشت، دانشگاه علوم پزشکی تهران، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>abbas</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>morovvati</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>عباس</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>مروتی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>Abbasmorovvati@gmail.com</email>
	<code>0386490414</code>
	<orcid>100319475328460019736</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Microbiology, Qom Branch, Islamic Azad University, Qom, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکروبیولوژی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد قم، قم، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
