<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Journal of Advanced Biomedical Sciences</title>
<title_fa>مجله علوم زیست پزشکی پیشرفته</title_fa>
<short_title>J Adv Biomed Sci.</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://jabs.fums.ac.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn></journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2783-1523</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>8</journal_id_pii>
<journal_id_doi>7</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>14</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>8888</journal_id_nlai>
<journal_id_science>13</journal_id_science>
<language>en</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1392</year>
	<month>6</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2013</year>
	<month>9</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>3</volume>
<number>2</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>مقایسه دو روشPCR و تست اوره آز سریع در شناسایی هلیکوباکتر پیلوری در نمونه بافت بیوپسی معده</title_fa>
	<title>Comparison PCR Method and Rapid Urease Test to Detect Helicobacter Pylori in the Gastric Biopsy Tissue Samples</title>
	<subject_fa>ميكروبیولوژی</subject_fa>
	<subject>Microbiology</subject>
	<content_type_fa>پژوهشي</content_type_fa>
	<content_type>Research</content_type>
	<abstract_fa>&lt;div align=&quot;right&quot; style=&quot;DIRECTION: rtl&quot;&gt;&lt;b&gt;زمینه و هدف:&lt;/b&gt; هلیکوباکترپیلـوری به عنوان یک عامل عمده خطـر در زخم‌های معده و دوازدهه و سرطان معده شناخته شده است. به علل مختلف، آزمایش‌هایی همانند کشت، کاملاً رضایت‌بخش نمی‌باشد. هدف از این مطالعه، مقایسه تست اوره‌آز (RUT) با روشPCR در شناسایی هلیکوباکتر پیلوری در نمونه های بافت بیوپسی معده می‌باشد. &lt;br&gt;&lt;b&gt;مواد و روش ها: &lt;/b&gt;ابتدا سوش استاندارد (H.pylori (N:oC30 تهیه گردید. در تستPCR از پرایمرهای ژن glmM (ureC) استفاده گردید. تست PCR به وسیله روشهای حساسیت و ویژگی بهینه گردید. سپس تعداد 100 نمونه ی مرضی متشکل از بافت بیوپسی معده تهیه گردید. تست اوره آز سریع بر روی تمامی نمونههای جمع آوری شده انجام گردید. از تمامی نمونه‌ها، به روش DNG استخراج DNA صورت گرفت. سپس نمونه ها توسط آزمون PCR بررسی گردیدند. &lt;/div&gt;&lt;div align=&quot;right&quot; style=&quot;DIRECTION: rtl&quot;&gt;&lt;b&gt;نتایج:&lt;/b&gt; در تست اپتیمایز شده PCR، محصول bp 294 تکثیرگردید. حساسیت تستPCR ،CFU 10 بدست آمد. در آزمون ویژگی با نمونه‌های DNA‌ی غیر از هلیکوباکتر پیلوری، هیچ محصول ناخواسته‌ای مشاهده نگردید. از 100 نمونه بافت بیوپسی معده، 64% از نمونه‌ها توسط تست اوره‌آز سریع و 76% توسط تست PCR، مثبت گزارش گردیدند. &lt;br&gt;&lt;b&gt;نتیجه‌گیری:&lt;/b&gt; با توجه به اینکه آزمون PCRدرتشخیص هلیکوباکترپیلوری در نمونه بافت بیوپسی دارای دقت، حساسیت و ویژگی بالاتری نسبت به تست اوره آز سریع می‌باشد، بنابراین از این روش می‌توان به منظور شناسایی H.pylori استفاده نمود. &lt;/div&gt;</abstract_fa>
	<abstract>&lt;b&gt;Background &amp; Objective: &lt;/b&gt;Helicobacter pylori has been recognized as a major risk factor in gastric and duodenum ulcers and gastric cancer. Some laboratory tests, such as culture, are not entirely satisfying. The aim of this study is to compare RUT with PCR in identifying H. pylori in the gastric biopsy tissue samples.&lt;br&gt;&lt;b&gt;Materials &amp; Methods:&lt;/b&gt; First, the standard H.pylori sample (N:oC30) was provided. primers or the glmM (ureC) gene were used In PCR method The PCR test was optimized by sensitivity and specificity methods. Then 100 clinical samples composed of stomach tissue biopsy were prepared. The rapid urease test was conducted on all obtained samples to identify H.pylori. DNA was extracted from samples using DNG plus technique. Then, samples were studied using PCR method.  &lt;br&gt;&lt;b&gt;Results:&lt;/b&gt; The 294 bp product was amplified in the optimized PCR test. The PCR test sensitivity was obtained at 10 CFU. Any unwanted products were not seen in the specificity test with the exception of H. pylori DNA samples. Of 100 stomach biopsy samples, 64% were reported as positive by RUT and 76% by the PCR test.&lt;br&gt;&lt;b&gt;Conclusion: &lt;/b&gt;Given that the PCR test has higher sensitivity and specificity to detect H.pylori comparing rapid ureaas test, therefore this method could be used to detect H.pylori.   &lt;br&gt;</abstract>
	<keyword_fa>هلیکو باکتر پیلوری، ژن glmM، روشPCR ، تست اوره آز سریع</keyword_fa>
	<keyword>Helicobacter pylori, glmM, PCR method, rapid Ureas test</keyword>
	<start_page>104</start_page>
	<end_page>110</end_page>
	<web_url>http://jabs.fums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-146-1&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Parastoo</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Chamanrokh</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>پرستو</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>چمن رخ</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>p.chamanrokh@gmail.com</email>
	<code>4723217207</code>
	<orcid>10031947532846002879</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Department of Biology, Science and Research Branch - Islamic Azad University,Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه زیست شناسی، واحد علوم و تحقیقات، دانشگاه ازاد اسلامی، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mohammad hassan</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Shahhosseiny</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>محمدحسن</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>شاه حسینی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>shahhosseiny@yahoo.com</email>
	<code>10031947532846002880</code>
	<orcid>10031947532846002880</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Microbiology, Islamic Azad University, Qods branch, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکروبیولوژی، واحد شهر قدس، دانشگاه آزاد اسلامی،  تهران، ایران </affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mahnaz</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Mazaheri Assadi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مهناز</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>مظاهری اسدی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>mahnazmazaheri@gmail.com</email>
	<code>10031947532846002881</code>
	<orcid>10031947532846002881</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Environmental Biotechnology Group, Biotechnology Department, Iranian Research Organization for Science and Technology,Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه بیوتکنولوژی محیط زیست ، گروه بیوتکنولوژی ایران، سازمان پژوهش های علمی و صنعتی، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Taher</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Nejadsattari</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>طاهر</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>نژاد ستاری</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>nejadsattari_t@yahoo.com</email>
	<code>10031947532846002882</code>
	<orcid>10031947532846002882</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Biology, Science and Research Branch - Islamic Azad University,Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه زیست شناسی، واحد علوم و تحقیقات، دانشگاه ازاد اسلامی، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Davood</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Esmaili</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>داوود</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>اسماعیلی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>esm114@gmail.com</email>
	<code>10031947532846002883</code>
	<orcid>10031947532846002883</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Biology, Science and Research Branch - Islamic Azad University,Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکروب شناسی، دانشکده علوم پزشکی، دانشگاه بقیه الله، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
