fa بررسی داکینگ مولکولی تعدادی از مشتقات هیدروکسی نیترو دی فنیل اتر به‌عنوان مهارکننده آنزیم تیروزیناز بيوشيمي بالینی Biochemistry پژوهشي Research <p dir="RTL"><strong>زمینه</strong> <strong>و</strong> <strong>هدف:</strong> تیروزیناز یک آنزیم کلیدی در تولید رنگ‌دانه است. اختلالات <em>مربوط به افزایش رنگ‌دانه </em>در نتیجه تولید بیش‌ازحد ملانین در پوست ایجاد می‌شود؛ بنابراین گسترش مهارکننده‌های این آنزیم در زمینه‌های پزشکی، آرایشی و کشاورزی حائز اهمیت است. هدف این پژوهش بررسی بیوانفورماتیکی مهار آنزیم تیروزیناز به‌وسیله‌ی تعدادی از مشتقات هیدروکسی نیترو دی فنیل اتر است.</p> <p dir="RTL"><strong>مواد</strong> <strong>و</strong> <strong>روش‌ها:</strong> این پژوهش به روش توصیفی<span dir="LTR"> &ndash;</span>تحلیلی انجام گرفت<span dir="LTR">.</span> برای بررسی نحوه اتصال ترکیبات به جایگاه فعال آنزیم، در ابتدا ساختار شیمیایی ترکیبات با استفاده از نرم‌افزار <span dir="LTR">ChemDraw</span> ترسیم شد سپس به‌منظور بهینه‌سازی انرژی، به نرم‌افزار <span dir="LTR">Hyperchem</span> انتقال یافت. مطالعات داکینگ به‌وسیله نرم‌افزار <span dir="LTR">AutoDock 4.2</span> انجام گرفت و در مرحله نهایی، نتایج با استفاده از سه برنامه <span dir="LTR">AutoDockTools</span>، <span dir="LTR">DS Visualizer</span> و <span dir="LTR">Ligplot</span> مورد آنالیز قرار گرفت.</p> <p dir="RTL"><strong>نتایج:</strong> در میان تمام ترکیبات موردمطالعه، بهترین نتایج داکینگ مربوط به ترکیب<span dir="LTR">4-Hydroxy- 2&#39;-nitrodiphenyl ether </span>&nbsp;است. در حقیقت این ترکیب با منفی‌ترین سطح انرژی اتصال (<span dir="LTR">Kcal/mol</span> 79/12-) تمایل بیشتری برای اتصال به آمینواسیدهای کلیدی جایگاه فعال تیروزیناز دارد. محل برهم‌کنش این ترکیب مشابه مولکول کوکریستال (تروپولن) است. در این ترکیب، اتم اکسیژن در گروه نیترو، با دو یون مس جایگاه فعال، پیوند فلزی مؤثری برقرار می‌کند.</p> <p dir="RTL"><strong>نتیجه‌گیری:</strong> در پایان با توجه به اثربخشی بالا و نتایج داکینگ می‌توان نتیجه گرفت که ترکیب <span dir="LTR">4-Hydroxy- 2&#39;-nitrodiphenyl ether</span> می‌تواند به‌عنوان مهارکننده مؤثر آنزیم تیروزیناز مطرح شود.</p> <p><strong><em>Background & Objective:</em></strong> Tyrosinase is a key enzyme in pigment synthesis<span dir="RTL">.</span>Overproduction of melanin in parts of the skin results in hyperpigmentation diseases. Thus, its inhibitors are highly important in the medical, cosmetic and agricultural fields. The aim of this research is the bioinformatical study of tyrosinase inhibition by a number of hydroxy nitrodiphenyl ether derivatives.</p> <p><strong><em>Material & Methods: </em></strong>This is a descriptive-analytic study. In order to investigate the mode of interaction of the compounds with tyrosinase active site, the chemical structures of all compounds were designed using ChemDraw program, then transferred into Hyperchem software for energy minimization. Docking study was performed by AutoDock 4.2 program and the resulting docking poses were analyzed in AutoDockTools, DS Visualizer 3.5 and Ligplot software.</p> <p><strong><em>Results: </em></strong>Among the all studied compounds, the best docking results were related to 4-Hydroxy- 2&#39;-nitrodiphenyl etherdisplayed. In fact, this compound had the most negative &Delta;G_bind(-12.79 Kcal/mol) that indicated favorable interactions with the key amino acid residues at active site of tyrosinase. Docking results for this compound are in accordance with those of co-crystallized ligand (tropolone). In this compound, the oxygen of nitro group has an efficient metal-ligand interaction with the Cu²⁺ ions in the active site.</p> <p><strong><em>Conclusion: </em></strong>Finally, in respect to&nbsp; high effectiveness and docking results, we can conclude that the compound 4-Hydroxy- 2&#39;-nitrodiphenyl ether may be regarded as an effective anti-tyrosinase inhibitor.</p> بیوانفورماتیک, داکینگ, هیدروکسی نیترو دی فنیل, تیروزیناز Bioinformatic, Docking, Hydroxy Nitrodiphenyl Ether, Tyrosinase 548 555 http://jabs.fums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1256-1&slc_lang=fa&sid=1 Fatemeh Sholehvar فاطمه شعله ور 100319475328460018028 100319475328460018028 No Young Researchers and Elites club, zarghan Branch, Islamic Azad University, zarghan, Iran باشگاه پژوهشگران جوان و نخبگان، واحد زرقان، دانشگاه آزاد اسلامی، زرقان، ایران Azizeh Asadzadeh عزیزه اسدزاده az.asadzadeh@yahoo.com 100319475328460018029 100319475328460018029 Yes Department of biology, faculty of science, Nour Danesh institute of higher education, Meymeh, Isfahan, Iran گروه زیست‌شناسی، دانشکده علوم پایه، موسسه آموزش عالی نور دانش، میمه، اصفهان، ایران Hooria Seyedhosseini حوریا سیدحسینی قهه 100319475328460018030 100319475328460018030 No Young Researchers and Elites club, Science and Research Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran دانشگاه آزاد اسلامی، واحد علوم و تحقیقات، باشگاه پژوهشگران جوان و نخبگان، تهران، ایران