<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Journal of Advanced Biomedical Sciences</title>
<title_fa>مجله علوم زیست پزشکی پیشرفته</title_fa>
<short_title>J Adv Biomed Sci.</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://jabs.fums.ac.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn></journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2783-1523</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>8</journal_id_pii>
<journal_id_doi>7</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>14</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>8888</journal_id_nlai>
<journal_id_science>13</journal_id_science>
<language>en</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1399</year>
	<month>3</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2020</year>
	<month>6</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>10</volume>
<number>2</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>بررسی مقایسه‌ای ژن‌های کارباپنمازهای تیپ‌های KPC، VIM، NDM وIMP   در ایزوله‌های بالینی و محیطی سودوموناس آئروژینوزا با پروتکل یکسان در روش Real Time PCR</title_fa>
	<title>A Comparative Study of KPC-, VIM-, NDM- and IMP-Type Carbapenemase Genes in Clinical and Environmental Isolates of Pseudomonas aeruginosa Using Similar Protocol in Real-Time PCR Method</title>
	<subject_fa>ميكروبیولوژی</subject_fa>
	<subject>Microbiology</subject>
	<content_type_fa>پژوهشي</content_type_fa>
	<content_type>Research</content_type>
	<abstract_fa>&lt;div style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;زمینه و هدف:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt; &lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;تولید آنزیم&#8204;های کارباپنمازی در ایزوله&#8204;های &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;سودوموناس آئروژینوزا&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; جداشده از بالین، درمان عفونت&#8204;های ناشی از این باکتری را به چالش کشانده است و با توجه به زیستگاه طبیعی این باکتری در محیط&#8204;های آبی و خاکی، این مطالعه در نظر داشت ژن&#8204;های کارباپنمازی &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;KPC&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;، &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;VIM&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;، &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;NDM&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; و&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;IMP &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;&amp;nbsp;را با پروتکل یکسان برای چهار ژن فوق با روش &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;Real-time PCR&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; در ایزوله&#8204;های بالینی و محیطی مورد مقایسه قرار دهد.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;مواد و روش&#8204;ها:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt; &lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;ایزوله&#8204;های بالینی از دو بیمارستان تبریز و ایزوله&#8204;های محیطی از آب رودخانه&#8204;های نهند و اسپیران جدا شد. جهت تعیین هویت ژنوتیپی آن&#8204;ها، از پرایمر یونیورسال &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;16s rRNA&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; استفاده شد. با روش فنوتیپی دیسک دیفیوژن آگار و دیسک ترکیبی ازنظر تولید کارباپنمازها موردبررسی واقع شدند و با استفاده از پرایمر های اختصاصی برای ژن&#8204;های موردنظر، مورد آزمون &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;Real- time PCR&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; واقع شدند.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;نتایج:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; با روش فنوتیپی 3/83% ایزوله&#8204;های بالینی و 0% از ایزوله&#8204;های محیطی مولد کارباپنمازها بودند. درحالی&#8204;که با روش &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;Real- time PCR&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; هم ایزوله&#8204;های بالینی و هم محیطی ژن&#8204;های &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;bla&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt; &lt;sub&gt;NDM-1&lt;/sub&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;، &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;bla&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt; &lt;sub&gt;IMP&lt;/sub&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;، &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;bla&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt; &lt;sub&gt;KPC&lt;/sub&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; و &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;bla&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt; &lt;sub&gt;VIM&lt;/sub&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; را نشان دادند.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;نتیجه&#8204;گیری&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;: این مطالعه نشان داد که ژن&#8204;های کارباپنمازی با یک پروتکل یکسان برای چهار ژن&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;KPC&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;، &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;VIM&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;، &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;NDM&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; و&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;IMP &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;&amp;nbsp;قابل&#8204;بررسی در ایزوله&#8204;های بالینی و محیطی است و وجود ژن&#8204;های فوق در ایزوله&#8204;های محیطی علاوه بر ایزوله&#8204;های بالینی اهمیت پخش این ارگانیسم را به&#8204;عنوان &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;Super bug&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; را بیش&#8204;ازپیش روشن می&#8204;سازد.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&amp;nbsp;&lt;/div&gt;</abstract_fa>
	<abstract>&lt;div style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;strong&gt;Background and objectives&lt;/strong&gt;: Production of Carbapenemase enzymes in &lt;em&gt;Pseudomonas aeruginosa&lt;/em&gt; isolated from clinic, has challenged the treatment of these infections and due to its natural habitat in soil and aquatic environments. This study aimed to compare carbapenemase resistance genes (VIM, KPC, NDM and IMP) using similar protocol for the four above-mentioned genes in clinical and enviromemtal isolates by Real-Time PCR.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;Materials and Methods&lt;/strong&gt;:&amp;nbsp; The clinical isolates were isolated from two Tabriz Hospitals and environmental isolates from Nahnad and Spiran rivers. For their genotypic idententification we used universal primer of 16s rRNA. They were investigated for Carbapenemase production via phenotypic disk agar diffusion and combined disk methods and then Real-Time PCR was conducted using specific primers for the above-mentioned genes.&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;Results:&lt;/strong&gt; By phenotypic methods, 83.3 percent of clinical and 0% of environmental isolates were Carbapenemase producers. However. both clinical and environmental isolates showed &lt;em&gt;bla&lt;/em&gt;&lt;sub&gt;NDM-1&lt;/sub&gt;, &lt;em&gt;bla&lt;/em&gt;&lt;sub&gt;IMP&lt;/sub&gt;, &lt;em&gt;bla&lt;/em&gt;&lt;sub&gt;KPC&lt;/sub&gt; and &lt;em&gt;bla&lt;/em&gt;&lt;sub&gt;VIM&lt;/sub&gt; genes by Real-Time PCR.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;Conclusion:&lt;/strong&gt; This study showed that the carbapenemase enzymes&amp;rsquo; genes in clinical and environmental isolates were checked for four KPC, VIM, NDM and IMP genes by similar protocol and the presence of above genes in environmental isolates. Furthermore, clinical ones revealed the possibility of bacteria spreading as a superbug increasingly. &lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;/div&gt;</abstract>
	<keyword_fa>کارباپنمازها, پسودوموناس آئروژینوزا, آب رودخانه, مقاومت ضد میکروبی</keyword_fa>
	<keyword>Carbapenemases, Pseudomonas aeruginosa, River Water, Antimicrobial resistance</keyword>
	<start_page>2308</start_page>
	<end_page>2316</end_page>
	<web_url>http://jabs.fums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-2325-1&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Jafar</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Babaei</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>جعفر</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>بابایی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>J.babaei@gmail.com</email>
	<code>5458969251</code>
	<orcid>100319475328460021996</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Basic Science, Tabriz Branch, Islamic Azad University, Tabriz, Iran  </affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه آزاد اسلامی واحد تبریز گروه علوم پایه، دانشگاه آزاد اسلامی واحد تبریز، تبریز، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Haedeh</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Mobaiyen</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>هائده</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>مبین</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>drhmobaiyen@gmail.com</email>
	<code>1372694511</code>
	<orcid>100319475328460021997</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Department of Microbiology, Tabriz Branch, Islamic Azad Uniersity, Tabriz, Iran  </affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکروبیولوژی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد تبریز، تبریز، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Amir Mehdi</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Khameneh</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>امیر مهدی</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>خامنه</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>khamanehamir@gmail.com</email>
	<code>1375662791</code>
	<orcid>100319475328460021998</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Molecular Medicine, Tabriz University of Medical Science,Tabriz, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه پزشکی مولکولی، دانشگاه علوم پزشکی تبریز، تبریز،  ایران</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
