fa بررسی داکینگ داروهای مجوزدار غیر ویروسی به‌منظور دست‌یابی به‌ مهارکننده‌های جدید ورود و تکثیر ویروس ابولا داروسازي و فارماکولوژِی Pharmacology پژوهشي Research <strong><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">زمینه و هدف: </span></span></strong><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">به دلیل قدرت و شیوع بالای عفونت&shy;زایی و عدم داروی مناسب ویروس ابولا طی سال‌های اخیر، پژوهش&shy;هایی در خصوص کشف و معرفی داروهای ضد ابولا انجام شده است. هدف از این پژوهش بررسی بیوانفورماتیکی مهار ورود و تکثیر ویروس ابولا توسط داروهای مجوزدار غیر ویروسی است.</span></span><br> <strong><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">مواد و روش&shy;ها:</span></span></strong><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;"> این پژوهش به روش توصیفی- تحلیلی انجام گرفت. برای انجام این بررسی بیوانفورماتیکی،</span></span> <span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">در ابتدا ساختار شیمیایی ترکیبات با استفاده از نرم‌افزار </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">ChemDraw Ultra10.0</span></span></span><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;"> ترسیم شد سپس به&shy;منظور بهینه&shy;سازی انرژی، به نرم&shy;افزار </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">Hyperchem8</span></span></span><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;"> انتقال یافت. مطالعات داکینگ به&shy;وسیله نرم&shy;افزار </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">AutoDock4.2</span></span></span><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;"> انجام شد و در مرحله نهایی، مورد آنالیز و تجزیه‌وتحلیل قرار گرفت.</span></span><br> <strong><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">نتایج:</span></span></strong><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;"> یافته&shy;های مطالعه حاضر نشان داد که پیوندهای درگیر در اتصال دارو با گیرنده&shy;ها، پیوند هیدروژنی، اتصالات هیدروفوبی، </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">&pi;</span></span></span><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">-</span></span><span style="font-size:8.0pt;">&pi;</span><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;"> و کاتیون-</span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">&pi;</span></span></span><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;"> می‌باشند. در میان تمام ترکیبات موردمطالعه، بهترین نتایج داکینگ مربوط به داروهای آمودیاکین، دیفنوکسیلات و کلروکینون است. در حقیقت این سه دارو با منفی&shy;ترین سطح انرژی اتصال تمایل بیشتری برای اتصال به اسیدهای آمینه جایگاه اتصال پروتئین&shy;های&shy; </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">GP</span></span></span><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;"> و </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">VP40</span></span></span><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;"> دارند. ضعیف&shy;ترین نتایج داکینگ مربوط به دو داروی دیریترومایسین و اریترومایسین است زیرا هیدروفیلیسیته این دو دارو بسیار زیاد است. به‌طورکلی، وجود بخش&shy;های هیدروفوب، آمین نوع سوم و پیوندهای هیدروژنی بهینه باعث افزایش قدرت ضد ابولای داروها می‌شود.</span></span><br> <strong><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">نتیجه&shy; گیری:</span></span></strong><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;"> بر اساس نتایج به‌دست‌آمده از مطالعات بیوانفورماتیکی، تمام داروها تأثیرات مهاری خوبی را در جایگاه اتصال گیرنده&shy;ها از خود نشان می‌دهند و می‌توانند به&shy;عنوان مهارکننده&shy;های مؤثر ورود و تکثیر ویروس ابولا مطرح شوند.</span></span><br> &nbsp;<br> <br> &nbsp; <strong><em>Background & Objective:</em></strong> Because of the reported high ability of virulence and the lack of appropriate drug of Ebola virus during the last decades, many investigations have been accomplished regarding discovery and the introduction of anti-Ebola drugs. The aim of this research was the bioinformatical study of entry and replication of Ebola viral inhibition by drug repurposing.<br> <strong><em>Materials </em></strong><strong><em><span dir="RTL">&</span></em></strong><strong><em> Methods:</em></strong> It is a descriptive-analytic study. In order to investigate the mode of interaction of the compounds with GP and VP40 binding sites, the chemical structures of all compounds were designed using ChemDraw program, then were transferred into Hyperchem software for energy minimization. Molecular docking simulation was accomplished using AutoDock 4.2 program.<br> <strong><em>Results: </em></strong>Docking results revealed the hydrophobic, hydrogen bond, &pi;-&pi; and &pi;-cation contacts were involved in the drug-protein interactions. Among all the studied drugs, the best docking results were related to Amodiaquine and Diphenoxylate drugs displayed. Actually, this compounds had the most negative &Delta;G_binding that indicated suitable modes and favorable interactions with the amino acid residues at the binding site of GP and VP40. The weakest docking results were exhibited for Dirithromycin and Erythromycin drugs due to the high hydrophilic character of them. In general, the presence of hydrophobic portions, tertiary amines, and optimal hydrogen bonds increases the strength of anti-Ebola medications.<br> <strong><em>Conclusion:</em></strong> According to the results of the molecular docking, the entire FDA-approved drugs revealed a good inhibition effect on entry and replication Ebola viral<br> &nbsp; داکینگ, ویروس ابولا, drug repositioning, پروتئین ماتریس ویروسی اصلی 40, گلیکو پروتئین Docking, Ebola viral, Drug repositioning, VP40, GP 1257 1266 http://jabs.fums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1878-1&slc_lang=fa&sid=1 Saghi Sepehri ساقی سپهری sepehri.saghi@yahoo.com 100319475328460019064 100319475328460019064 Yes Department of Medicinal Chemistry, School of Pharmacy, Ardabil University of Medical Sciences, Ardabil, Iran گروه شیمی دارویی دانشکده داروسازی، دانشگاه علوم پزشکی اردبیل، اردبیل، ایران Vahed Adhami واحد ادهمی 100319475328460019065 100319475328460019065 No Department of Medicinal Chemistry, School of Pharmacy, Ardabil University of Medical Sciences, Ardabil, Iran گروه شیمی دارویی دانشکده داروسازی، دانشگاه علوم پزشکی اردبیل، اردبیل، ایران